ゲノム比較と人流データの統合活用に基づく結核の伝播経路推定
完了
関本 義秀
結核は患者から患者へと伝染する感染症であり、その伝播経路推定は公衆衛生上において重要である。近年、患者由来の臨床分離株を遺伝子解析し、その相同性から感染源を推定する「分子疫学解析」が着目されている。本手法は感染伝播の科学的根拠として利用され、自治体における感染対策などにも導入されつつある一方、患者情報との統合的な解析、未知の伝播経路の解明においては十分に役割を果たしているとは言いがたい現状にある。 感染症の伝播には、感染源となる発症患者と被感染者が空間的に接触する必要があり、患者の居住地や移動パターンが病原体伝播の疫学的背景として重要な意義を持つ可能性が高い。そこで本課題では、メッシュごとの居住者における移動データから接触度を算出し、それに基づいてメッシュ間の距離を定義するとともに、結核菌株のゲノム比較から導き出された患者間伝播の実状との相関性を分析する。人が社会生活を営む中で起こる人流と、病原体ゲノミクスに基づく感染症伝播のエビデンスをつなぐことにより、新たな感染症モデルを生み出すとともに、結核分子疫学の抜本的な向上を目指す。
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中谷 友樹 / 東北大学大学院環境科学研究科
藤原 直哉 / 東北大学大学院情報科学研究科
竹内 昌平 / 長崎県立大学看護栄養学部栄養健康学科
和田 崇之 / 大阪市立大学 生活科学研究科
山本 香織 / 大阪健康安全基盤研究所
瀬戸 順次 / 山形県衛生研究所
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【空間配分版】 2010年近畿都市圏 人の流れデータセット
【空間配分版】2004年ハノイ 人の流れデータセット
【空間配分版】2009年ダッカ 人の流れデータセット
【空間配分版】2008年東京都市圏 人の流れデータセット
【空間配分版】2002年ジャカルタ 人の流れデータセット
【空間配分版】 2003年ホーチミン都市圏 人の流れデータセット
Zmap TOWN II 2008/09年度（Shape版）大阪府 データセット
Zmap TOWN II (2022年度 Shape版) 大阪府 データセット
座標付き電話帳DBテレポイント（P1A02_2010年2月）
座標付き電話帳DBテレポイント 法人版（P1B08_2021年8月）
擬似人流・人口属性データ 大阪府データセット
擬似人流・活動データ 大阪府データセット
擬似人流・トリップデータ 大阪府データセット
拡張版全国デジタル道路地図データベース 2023年版
拡張版全国デジタル道路地図データベース 2015年版
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